Cụ thể, Cục Tài chính doanh nghiệp cơ quan này đã lọc ra danh sách 480 doanh nghiệp FDI có doanh thu tăng trưởng cao nhưng lỗ liên tục năm 2009 và 2010, 308 doanh nghiệp FDI lỗ lũy kế mất vốn, 147 doanh nghiệp FDI  có hiệu quả sản xuất "có vấn đề"  trong ba năm 2008 - 2010 chưa phát sinh thu nhập chịu thuế và vẫn trong tình trạng thua lỗ kéo dài; cùng 38 doanh nghiệp làm ăn thua lỗ trong năm 2010...  sẽ đưa vào thanh tra gấp trong năm 2012.

Trước những ý kiến cho rằng hiện tượng chuyển giá ngoài do những sơ hở của chính sách thì sự yếu kém của cán bộ ngành Thuế tiếp tay cũng là lí do tình trạng này kéo dài, Thứ trưởng Bộ Tài chính Đỗ Hoàng Anh Tuấn thừa nhận, lực lượng ngành thuế mới 58% có trình độ đại học. Hơn nữa, nhiều cán bộ thanh tra thuế không thể làm tốt ngay khi mà kinh nghiệm, kỹ năng và trách nhiệm chưa thật sự cao. Trong khi đó, các ông chủ của doanh nghiệp lớn, nhất là các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài, rất giỏi, có kinh nghiệm làm ăn, kinh doanh khắp thế giới.

Theo Thứ trưởng Tuấn, chính vì những nhu cầu công việc căng thẳng như hiện nay nên càng đòi hỏi đội ngũ cán bộ thanh tra chống chuyển giá cần phải được nâng cao trình độ hơn nữa. Để thực hiện tốt việc thanh tra, kiểm tra đối với doanh nghiệp thì bản thân cán bộ thanh tra thuế phải có đủ năng lực đánh giá từng hồ sơ, phát hiện những dấu hiệu của hiện tượng chuyển giá... Ngoài ra, các thông tin về thị trường, tỉ suất lợi nhuận ngành... phải được chuẩn bị đầy đủ.

Về vấn đề thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN); giảm xuống mức 20% hay giữ 25% như hiện nay nhằm hỗ trợ doanh nghiệp, góp phần chống lại hiện tượng chuyển giá, Thứ trưởng cho biết,  Bộ Tài chính cũng đang cân nhắc trong thời gian tới. Tuy nhiên, so với các nước trong khu vực ASEAN, thuế TNDN của Việt Nam chỉ cao hơn Singapore 19%. Trong khi lại thấp hơn Malaysia 32%, Thái Lan 30%...